Blandt Frankrigs mange museer skiller Musée Fabre sig ud ved den fremragende kvalitet af sine samlinger — opbygget over tid af en håndfuld kyndige samlere, alle fra regionen og stolte over at have bidraget til at skabe et eksemplarisk museum uden for Paris. Den store renovering i 2007 kronede mere end to århundreders bestræbelser på at fremme kunsten i Montpellier. En film ved indgangen til Atrium byder nu besøgende velkommen med en rejse gennem museets historie, fra dets oprindelse til den store renovering, og hylder de centrale skikkelser, der formede det, gennem animerede planer, fotografier og arkivbilleder.
Samlingen udfolder sig over flere store ruter. Gamle Mestres-ruten (rum 2–36) præsenterer maleri og skulptur fra renæssancen til begyndelsen af det 19. århundrede — en rejse gennem Frankrig, Italien, Nederlandene og Spanien, efterhånden som europæisk kunst genopdagede antikken, opfandt perspektivet og forfinede sin modellering, og gradvist gjorde kunsten til en verden for sig med egne regler, forbilleder og mestre. Den moderne og samtidige rute (rum 37–52) kan læses som en lyshistorie i maleriet: et panorama over fransk kunst fra det 19. århundrede efterfulgt af store skikkelser fra det 20. århundrede, forankret i den exceptionelle gave fra Montpellier-samleren Alfred Bruyas (1821–1877) — et af de mest komplette vidnesbyrd om hans tid, der spænder over romantik, naturalisme, Barbizon-skolen og realisme. Den beriges af to fremtrædende lokale kunstnere, Alexandre Cabanel (1823–1889) og Frédéric Bazille (1841–1870), og løber gennem impressionistiske eksperimenter og fauvistisk og ekspressionistisk farve helt frem til den "noir-lumière", som Pierre Soulages opfandt i 1979.
Et kort stykke derfra huser afdelingen for kunsthåndværk Hôtel de Cabrières-Sabatier d'Espeyran, et palæ opført i 1874 og skænket til museet i 1967 — et sjældent indblik i Montpelliers borgerskabs livskunst i det 19. århundrede. Stueetagen viser museets keramik og guldsmedearbejder, de første etages modtagelsessaloner fremkalder livet og smagen hos de oprindelige ejere, Despous de Paul, i smukt bevarede interiører, og den mere intime anden etage tegner en stilhistorie fra Régence til begyndelsen af det 19. århundrede.
Museet er også berømt for sit kabinet med grafiske kunstværker — mere end 5.000 ark tegninger, raderinger og tryk samlet takket være generøse regionale donorer (Fabre, Valedau, Bonnet-Mel, Canonge, Bruyas, Cabanel). Det spænder fra italienske renæssancetegninger (Raphael, Daniele da Volterra) til bemærkelsesværdige franske og neoklassiske værker fra det 17. århundrede (Le Brun, Le Sueur, Fabre, Gauffier) og moderne navne som Hugo, Matisse og Hollan. Da arbejder på papir er så skrøbelige, opbevares de i magasinet og vises kun periodisk — tre måneder hvert tredje år, i meget svagt lys — fuldt digitaliserede online og præsenteret sæson for sæson i tematiske udstillinger. Blandt museets mange mesterværker finder man Bazilles Vue de village (1868), Zurbaráns Sainte Agathe, Sébastien Bourdons L'Homme aux rubans noirs, Matisses Femme accoudée sur le bras d'un fauteuil (1941), Simon Hantaïs Blanc (1974) og en Raphael-studie, Homme penché en avant.
Programmet er livligt året rundt. Den store midlertidige udstilling Guimet + Chine løber frem til 1. november 2026, og fra den 27. juni 2026 præsenterer museet Le Design selon Pierre Paulin (1927–2009), en stor retrospektiv om den fejrede designer — og den allerførste udstilling, Fabre har viet til design fra det 20. århundrede. Ud over udstillingerne afspejler en fuld kalender med arrangementer, workshops og familiedage museets mission om at åbne kulturen for det bredest mulige publikum.
Rig, eksemplarisk og dybt forankret i sin by er Musée Fabre et af Frankrigs store kunstmuseer — et sted at rejse gennem fem århundreder af maleri, skulptur og kunsthåndværk, midt i hjertet af Montpellier.